Štátnou vlajkou Maltézskeho rádu je červená štvorcová vlajka s bielym latinským krížom. Jej názov je „Vlajka sv. Jána“, a používa sa od dávnych čias. Kniha „História Rádu“ od Giacoma Bosioa (1594) zachytáva dekrét pápeža Innocenta II. z roku 1130, v ktorom pápež uvádza, že „...Náboženstvo by vo vojne malo nosiť štandardu s bielym krížom a červeným pozadím“. V súlade s ustanoveniami Buly pápeža Alexandra IV. z roku 1259 povoľujúcu rytierom vo vojne nosiť červený plášť s bielym krížom, začal Rád systematicky používať latinský kríž aj ako svoj emblém. V roku 1291 Maltézsky rád opustil Svätú Zem a presídlil sa na Cyprus. V tomto období nastal najväčší rozmach námorného loďstva rádu, a od tých čias viala táto vlajka na lodiach rádu ďalších šesť storočí. V súčasnosti štátna vlajka rádu veje nad Magistrálnym palácom v Ríme popri vlajke (štandarde) Veľmajstra, v prítomnosti členov Zvrchovanej rady, ako aj pri oficiálnych návštevách.
Červená vlajka s osemramenným bielym krížom je vlajkou Rádových diel. Osemramenný kríž sa v Ráde používa rovnako dlho, ako latinský kríž a jeho pôvod má korene v historických prepojeniach rádu s Republikou Amalfi. Jeho súčasná forma sa používa už viac ako 400 rokov. Prvá zmienka o osemramennom kríži sa objavila v súvislosti s jeho vyobrazením na minciach Veľmajstra Fra´ Foulques de Villaret (1305-1319). Špitálna vlajka veje na sídlach veľkopriorátov a podpriorátov rádu. Používa ju aj 47 národných asociácií rádu a viac ako 100 diplomatických zastupiteľských úradov rádu po celom svete. Veje aj nad nemocnicami, zdravotníckymi centrami a poliklinikami, ako aj všade tam, kde rádové záchranné zbory, nadácie a špecializované jednotky vykonávajú svoju humanitárnu činnosť, alebo charitatívne aktivity.
Štandarda veľmajstra má podobu červenej vlajky s bielym osemramenným krížom, okolo ktorého je prepletená reťazová insígnia Veľmajstra s korunou umiestnenou na jej vrchole. Vlajka veje nad Magistrálnym Palácom a na magistrálnych sídlach Rádu v čase, kedy je veľmajster prítomný.
Emblém rádu sa skladá z bieleho latinského kríža v červenom oválnom poli, po obvode ktorého je umiestnený ruženec. Medzi oválnym poľom s latinským krížom a ružencom sa nachádza biely osemramenný kríž. Emblém je prikrytý kniežacím plášťom na vrchu ktorého je zvýraznená kniežacia koruna. Používa sa ako výsostný znak Veľkého magistéria Maltézskeho rádu a jeho inštitúcií, medzi ktoré patria veľkoprioráty, podprioráty, národné asociácie a diplomatické misie.
Znak Maltézskeho rádu (rádových diel) pozostáva z červeného štítu s bielym osemramenným krížom tak, ako ustanovuje článok 242 Kódexu Maltézskeho rádu. Znak sa používa ako symbol špitálnych a humanitárnych aktivít Rádu po celom svete.
Jakubovo námestie 7 - 81109 Bratislava | Telefón: +421 2 4319 3019 | E-mail: info@orderofmalta.sk