Centrum činností
Nad hlavným vchodom do Magistrálneho paláca z ulice Via dei Condotti vejú dve vlajky Maltézskeho rádu - vlajka sv. Jána, ako štátna vlajka a vlajka špitálnej činnosti rádu. Štandarda veľmajstra je vyvesená vždy v čase, ak sa veľmajster nachádza vo svojej rezidencii. V paláci sú prijímané hlavy štátov, členovia diplomatického zboru a vyšší členovia rádu zo všetkých častí sveta. Palác slúži tiež ako miesto, kde sa schádzajú ku svojej činnosti orgány Vlády rádu. Každý deň ráno sa v kaplnke paláca koná svätá Omša. Kaplnka je zasvätená patrónovi rádu sv. Jánovi Krstiteľovi.
V priestoroch paláca sa nachádzajú aj Magistrálna knižnica a Magistrálny archív, ktoré tvoria kultúrne centrum Rádu. Keďže tradíciou Rádu je zakladanie nemocníc všade, kde pôsobí, na prvom poschodí paláca sa nachádza aj centrum pre dennú zdravotnú starostlivosť. V paláci majú svoje miesto aj Magistrálna mincovňa a Magistrálna pošta. Poštové zásielky označené známkou Rádu môžu byť z tohto miesta odoslané do 57 krajín sveta, s ktorými má Rád uzatvorené medzinárodné dohody o poštovom styku. V paláci bolo otvorené aj nové informačné centrum, ktoré pre záujemcov z radov návštevníkov ponúka informácie o Ráde a jeho činnosti.
V paláci sa nachádzajú aj vládne oddelenia pre vnútorné záležitosti, zahraničné veci, špitálne a charitatívne záležitosti, financie a komunikačný odbor Maltézskeho rádu.
